NMR-resurs med specialistkompetens

Text: Li Gessbo Publicerad: 30 augusti 2016
Professor Corine Sandström förestår NMR-resursen på SLU. Efter drygt 25 år som NMR-specialist och forskare erbjuder hon en analyskompetens som är värd mycket. Resursen är tillgänglig för såväl SLU-medarbetare som externa forskare.
Corine Sandström, SLU. Foto: Jenny Svennås-Gillner, SLU

Corine Sandström. Foto: Jenny Svennås-Gillner, SLU

Corine Sandström är professor i organisk kemi och forskningsledare för NMR-spektroskopiinfrastrukturen och den NMR-baserade metabolomikplattformen vid SLU. I forskningen behövs ofta också masspektrometri (MS) i kombination med NMR-spektrometri och plattformen erbjuder även den resursen.

Vi har expertisen! Och vi gör analysen.

Ny kunskap för bättre mat, medicin och drivmedel

I sin egen forskning arbetar Corine med att undersöka biomolekylstrukturer och deras interaktioner på atomnivå för att se samband mellan aktivitet och egenskaper. Hennes arbete går också ut på att utveckla mätmetoderna.

– Tillsammans med andra forskare försöker vi till exempel hitta enzymer hos alger och mikroorganismer som kan användas för att modifiera polysackarider. Dessa polysackarider som har nya strukturer och därför nya egenskaper kan användas för att kunna utveckla till exempel bättre mat eller läkemedel.

Corine samarbetar med mikrobiologer, molekylärbiologer och biokemister både vid SLU och andra lärosäten, såväl i Sverige som i andra länder. Metabolomikstudier görs exempelvis tillsammans med forskare vid Uppsala universitet och Karolinska Institutet om tuberkulos och diabetes. Även forskningssamarbeten med företag förekommer, exempelvis om biodrivmedel, antibiotika och hydrogeler.

Analys som kräver expertis

NMR-spektrometrin vid SLU är högklassig och högkänslig och kan hantera allt från mycket små mängdprover till hela växt- eller vävnadsbitar, även levande celler.

– Vid sjukhus i Norge används NMR för att analysera vävnadsprover, både för diagnostik och som vägledning i behandling. Det gör vi inte än men vi har tekniken! Det går att analysera såväl plasma och urin som vävnader, säger Corine.

Utöver de moderna instrumenten kan NMR- och MS-resursen även utföra analysen av spektroskopidata, som ofta är det som är mest tidskrävande. Forskningsgruppen vid SLU har 13-15 medarbetare som vid sidan av Corine erbjuder sin expertis.

Expertisen vid SLU:s NMR-baserade metabolomikplattform:  Överst, från vänster: forskare Anders Sandström, forskningsingenjör Peter Agback, doktorand Johnny Östman.  Mitten: doktorand Hanna Eriksson Röhnisch, doktorand Frida Wende, postdok Lena Lundqvist, postdok Christina Nord, forskningsingenjör Suresh Gohil, postdok Elizabeth Müllner, Corine Sandström.  Längst fram: forskare Emad Ehtesham, forskare Ali Moazzami, forskare Jan Eriksson, professor Anders Broberg.

Expertisen vid SLU:s NMR-baserade metabolomikplattform. Överst, från vänster: forskare Anders Sandström, forskningsingenjör Peter Agback, doktorand Johnny Östman. Mitten: doktorand Hanna Eriksson Röhnisch, doktorand Frida Wende, postdok Lena Lundqvist, postdok Christina Nord, forskningsingenjör Suresh Gohil, postdok Elizabeth Müllner, professor Corine Sandström. Längst fram: forskare Emad Ehtesham, forskare Ali Moazzami, forskare Jan Eriksson, professor Anders Broberg. Foto: Frida Wende och Emad Ehtesham, SLU

– Vi har expertisen! Och vi gör analysen, säger Corine.

På önskelistan för framtiden står mer personal för att hinna med alla uppdrag och en komplettering av utrustningen för att ännu bättre kunna arbeta med prover på hela skalan från lösning till fast vävnad.

Fakta

NMR-resursen vid SLU

NMR (nuclear magnetic resonance) står för kärnmagnetisk resonans. NMR-spektrometri används inom till exempel metabolomikforskningen och är den enda teknik som erbjuder analys av biomolekyler i lösning på atomnivå.

SLU:s metabolomikplattform består av två NMR-spektrometrar samt tre masspektrometrar. Utöver instrumenten finns också analysexpertisen. Resursen är tillgänglig för forskare vid SLU och vid andra universitet. Även rena serviceuppdrag från industrin tas emot i mån av tid.

Läs mer om NMR- och MS-laboratoriet hos institutionen för kemi och bioteknologi.

Corine Sandström är forskningsledare för metabolomikplattformen vid SLU. Hon kom till en forskarassistenttjänst vid SLU 1996 och redan då som NMR-specialist. Sedan 2011 är hon professor i organisk kemi med inriktning på biomolekylers struktur och egenskaper. Läs mer om Corine i ”professorsinstallationer vid SLU 2013”, sid. 72.

Summary in English

NMR facility offers unique expertise

The NMR facility at SLU is managed by Professor Corine Sandström. With over 25 years of experience as an NMR specialist and researcher, she contributes highly valuable analysis skills.

The facility is available to both SLU staff and external researchers. For those who need mass spectrometry (MS) in combination with NMR spectrometry, that service is also available.

The NMR spectrometry at SLU is high-class and high-sensitive, and can handle anything from minute samples to pieces of plants or tissue, including living cells.

In addition to the modern equipment, the NMR/MS facility can also be used to analyse spectroscopic data, often the most time-consuming aspect. The SLU research group consists of 13–15 staff who, like Corine, are happy to contribute their expertise.

Facts

NMR is the abbreviation for nuclear magnetic resonance. NMR spectrometry is used in for example metabolomic research, and it is the only technique that offers analysis of biomolecules in a solution at atomic level.

The SLU metabolomics platform consists of two NMR spectrometers and three mass spectrometers. In addition to this equipment, the platform also offers analysis expertise and it is available to researchers at SLU as well as at other universities.

Read more about the NMR/MS laboratory at the Department of Chemistry and Biotechnology.

30 augusti 2016 20
Klimatsmart narkos ger mervärden

Klimatsmart narkos ger mervärden

Miljöarbete Tjugo procents minskning av koldioxidutsläpp är målet för ett av de tre projekt som fick medel från miljöfondens första utlysning för snart två år sedan. Det är Universitetsdjursjukhuset (UDS) som med hjälp av utbildning och ny utrustning har lyckats minska användningen av inhalationsläkemedlet isofluran vid operationer. Den årliga förbrukningen av isofluran vid UDS motsvarar ett koldioxidutsläpp från 25.000 mil i bil, vilket är fram och tillbaka mellan Uppsala och Sundsvall varje dag i ett år.
2 juni 2017
Vi har en vinnare!

Vi har en vinnare!

Rätt svar Grattis till er som svarat rätt i tävlingen om brandsäkerhet vid SLU. Nu dragningen av vinnarna klar, Christine Jakobsson vann första pris, en brandsläckare. Och hon har egna erfarenheter av brandtillbud. – Jag har för ett antal år sedan hindrat en brand hemma då jag kände att det luktade en svag kryddig röklukt när jag kom in i huset från stallet. Trots att jag var osäker på om det verkligen var något ringde jag brandkåren. Det visade sig vara en pyrande skorstenbrand som tack och lov aldrig tog sig.
7 juni 2017
Det handlar om helheten

Det handlar om helheten

Krönika Livsmedelsproduktionens hållbarhet diskuteras flitigt vid SLU och på andra ställen. I SLU:s miljöpolicy nämns ”ekologiskt, socialt och ekonomiskt hållbar utveckling”. Vi pratar också om etiskt hållbar utveckling och vid VH-fakulteten har vi stor tonvikt vid etik inom djurhållning. Det finns stor kunskap, men även behov av ny kunskap, för att lösa respektive mål. Det är dock när flera faktorer skall vägas samman till en helhet som utmaningarna blir riktigt stora. Är det möjligt att producera riskfria, nyttiga och goda animala livsmedel med hänsyn till såväl djurvälfärd, klimat- och miljöeffekter på ett sätt som gör att lantbrukaren kan erbjuda sina anställda en bra arbetsmiljö och samtidigt ta ut lön till sig själv?
2 juni 2017

Twitter

Vita älgar DNA-testas vid SLU. https://t.co/pkuJpIPxmb https://t.co/MWDEKkPC5d @_SLU via Twitter 3 dagar sedan
På fredag släpps Mistra Biotechs nya podcast om växtförädling och djuravel – Shaping our food! Det ser vi fram emot! https://t.co/S4dQSQOiqQ @_SLU via Twitter 4 dagar sedan
Barriär för växtförädlare förklarad i detalj https://t.co/5mvu2adXmB @_SLU via Twitter 9 dagar sedan
RT @CORDIS_EU: @_SLU Please retweet and like the following post on a project to which you participate https://t.co/vud5fqA5Bo @_SLU via Twitter 17 dagar sedan
Så blir kräftfångsterna i år https://t.co/xBZOh9a5FL https://t.co/yXoPKnMWNZ @_SLU via Twitter 19 dagar sedan
SLU bidrar med kompetens för ett globalt hållbart och rättvist fiske https://t.co/tBsEcsZZmn @_SLU via Twitter 23 dagar sedan